PT LHE didirikan pada tanggal 26 Januari 2015 berdasarkan Akte Nomor 04 dibuat dihadapan Gunawati, S.H. Notaris di Medan, yang telah mendapat pengesahan dari Menteri Hukum dan Hak Asasi Republik Indonesia No. AHU-0009236.AH.01.01 Tahun 2015 tanggal 27 Pebruari 2015. Perseroan memiliki 99% saham PT Sei Wampu Energy dan sisanya 1% dimiliki oleh PT. Tapanuli Investasi Agro (PT TIA).

Pada tanggal 22 Nopember 2017 PT Langkat Hidro Energi meningkatkan modal ditempatkan dan disetor dari sebelumnya sebanyak 2.500 saham dengan nominal sebesar Rp. 2.500.000.000,- menjadi sebanyak 5.000 saham dengan nominal sebesar Rp. 5.000.000.000,- berdasarkan Akte Pernyataan Keputusan Rapat Para Pemegang Saham No. 7, dibuat oleh Gunawati,S.H. notaris di Medan yang telah mendapat pengesahan dari Menteri Hukum dan Hak Asasi Republik Indonesia No. AHU-0149565.01.11 Tahun 2017 tanggal 24 Nopember 2017. Dari peningkatkan modal ditempatkan dan disetor Perseroan mengambil bagian sebanyak 2.475 saham dengan nominal sebesar Rp. 2.475.000.000,- dan PT. Tapanuli Investasi Agro sebanyak 25 saham sehingga Perseroan memiliki 99% saham dengan nilai nominal sebesar Rp. 4.950.000.000,- sedangkan sisanya sebesar 1%  dengan nilai nominal sebesar Rp. 50.000.000,- dimiliki oleh PT. Tapanuli Investasi Agro.